La taxonomie a son origine dans un mot grec qui signifie "ordination" . C'est la science de la classification appliquée en biologie pour l' organisation systématique et hiérarchique des groupes d'animaux et de plantes .

Plus précisément, nous pouvons déterminer que la taxonomie est divisée en deux: la microtaxonomie, chargée de délimiter et de décrire certaines espèces; et macrotaxonomy, qui est celle qui se classe sur la base des critères accordés par la branche précédente.

Il est également important d'établir que la taxonomie est étroitement liée à ce que l'on appelle la systématique. Cela peut être défini comme la science responsable de l'étude des relations de parenté, également appelées affinités, qui existent entre différentes espèces.

Tout cela sans oublier le lien étroit qui existe entre la taxonomie et d’autres sciences ou questions telles que l’évolution, la paléontologie, la génétique, la biologie moléculaire, la phylogénie ou l’embryologie.

La taxonomie biologique fait partie de la biologie systématique, dédiée à l'analyse des relations de parenté entre organismes. Une fois que l'arbre phylogénétique de l'organisme en question est résolu et que ses branches évolutives sont connues, la taxonomie est chargée d'étudier les relations de parenté.

En plus de tout cela, il faut souligner que lorsqu'on travaille avec la taxonomie, la développe et la met en pratique, il est essentiel de clarifier les différents concepts qui la sous-tendent. Ce serait le cas de ce qui suit:

Caractère, qui vient se référer aux caractéristiques de la plante, par exemple.

Etat du personnage, c'est-à-dire les valeurs que le personnage peut acquérir.

Les caractères de diagnostic sont ceux qui sont clairement utilisés pour distinguer les taxons.

Personnages dérivés. Ils sont identifiés comme étant d'un type dynamique et parce qu'ils peuvent fournir des informations sur l'apparence de nouvelles lignées. Tout cela peut être fait par ceux qui sont les états qui peuvent avoir un caractère d'une manière différente de leur ancêtre, car ils sont modifiés.

Il existe différentes positions en ce qui concerne la taxonomie, même si, en général, on affirme que sa fonction commence lorsque la phylogénie des taxons est déjà définie. C'est pourquoi la taxonomie organise l'arbre phylogénétique dans un système de classification.

Selon l'opinion la plus répandue, les taxons sont des clades (branches de l'arbre phylogénétique, avec des espèces apparentées à un ancêtre commun) déjà classés dans une catégorie taxonomique.

Le processus de taxonomie se poursuit avec l'attribution de noms (selon les principes de la nomenclature), l'élaboration des clés d'identification dichotomiques et la création des systèmes de classification.

Les taxons permettent de classer les êtres vivants dans une hiérarchie d'inclusion (chaque groupe comprend d'autres mineurs tout en étant subordonnés à un plus grand). Les catégories fondamentales, du plus complet au plus petit, sont le domaine, le royaume, la lisière ou division, la classe, l' ordre, la famille, le genre et l' espèce .

Il convient de noter que les progrès des connaissances sur l’ADN et les problèmes de biodiversité posent de grands défis pour la taxonomie.